Спаси Господи. Архиерею о препятствии нужно говорить при поступлении в семинарию или перед рукоположением?
Обучение в Семинарии не означает автоматического принятия сана священнослужителя. Посему, рекомендую Вам обсудить этот вопрос с духовником, который должен будет писать на Вас характеристику Правящему архиерею.